Никитюк Александр Сергеевич Сергеевич, 12.04.1990

Кандидат физико-математических наук, научный сотрудник лаборатории Физических основ прочности Института механики сплошных сред УрО РАН, доцент кафедры математического моделирования и процессов Пермского Национального Исследовательского Политехнического Университета.

Электронная почта: nas@icmm.ru

Образование:

2013 — Окончил факультет прикладной математики и механики Пермского Национального Исследовательского Политехнического Университета (ПНИПУ).

2013 — Поступление в аспирантуру по направлению «Механика деформированного твердого тела».

2020 — Защита кандидатской диссертации на тему «Математическая модель нелинейной кинетики молекулы ДНК и ее применение для анализа клеточной динамики».

Профессиональный опыт:

Пермский Национальный Исследовательский Политехнический Университет (ПНИПУ)

МБОУ Лицей №1 г. Пермь

Институт механики сплошных сред УрО РАН

Научный сотрудник лаборатории Физических основ прочности Института механики сплошных сред УрО РАН (с 2020 г.), доцент кафедры математического моделирования и процессов Пермского Национального Исследовательского Политехнического Университета (с сентября 2025).

Научная и исследовательская деятельность:

Ключевыми направлениями исследований являются экспериментальное и теоретическое изучение нано-, мезоструктурной динамики биологических и химических систем с использованием оригинальных экспериментальных результатов.

А.С. Никитюком было опубликовано за 2020-2025 годы 70 печатных работ, включающих издания из базы цитирования WoS, SCOPUS и РИНЦ. Индекс Хирша в изданиях, индексируемых: Web of Science Core Collection – 3, Scopus – 4, РИНЦ – 4. Также имеется 1 Евразийский патент и 12 свидетельств о государственной регистрации программы для ЭВМ.

А.С. Никитюк прошел стажировки в известных зарубежных исследовательских центрах, специализирующихся в области механобиологии и биофизики (Лаборатория Физики Конденсированного состояния Университет Пьера и Марии Кюри, Париж, Франция; Институт Биофизики Университета Бремена, Германия).

Лауреат Премии Пермского края в области науки II степени за лучшую научную работу в области медицины за 2023 год.

1. Lyapunova, E. Passive microrheology of normal and cancer cells after ML7 treatment by atomic force microscopy / E. Lyapunova, A. Nikituk, Y. Bayandin, O. Naimark, C. Rianna, M. Radmacher // AIP Conference Proceedings “International Conference on Physics of Cancer: Interdisciplinary Problems and Clinical Applications (PC’16)”. – 2016. – Vol. 1760, Issue 1. – P. 020046. http://dx.doi.org/10.1063/1.4960265 DOI: 10.1063/1.4960265

2. Naimark, O.B. The physics of cancer: The role of epigenetics and chromosome conformation in cancer progression / O.B. Naimark, A.S. Nikitiuk, M.-O. Baudement, T. Forne, A. Lesne // AIP Conference Proceedings “International Conference on Physics of Cancer: Interdisciplinary Problems and Clinical Applications (PC’16)”. – 2016. – Vol. 1760, Issue 1. – P. 020051. http://dx.doi.org/10.1063/1.4960270 DOI: 10.1063/1.4960270

3. (In Russian) Gerasimova-Chechkina, E.I. Multiscale experimental and theoretical study of mechanobiology and tumor homeostasis / E.I. Gerasimova-Chechkina, A.S. Nikitiuk, E.A. Lyapunova, O.S. Gileva, O.B. Naimark // Bulletin of the Perm Scientific Center of UrB RAS. – 2017. - No1. – P. 39-45. http://journal.permsc.ru/index.php/pscj/article/view/PSCJ2017n1p6

4. Nebogatikov, V. Study of morphological changes in breast cancer cells MCF-7 under the action of pro-apoptotic agents with laser modulation interference microscope MIM-340 / V. Nebogatikov, A. Nikitiuk, A. Konysheva, P. Ignatyev, V. Grishko, O. Naimark // AIP Conference Proceedings «International Conference on Physics of Cancer: Interdisciplinary Problems and Clinical Applications (PC IPCA’17)». – 2017. – Vol. 1882, No. 1. – P. 020053. http://dx.doi.org/10.1063/1.5001632DOI: 10.1063/1.5001632

5. Rogotnev, A.A. The Mathematical Cell Model Reconstructed from Interference Microscopy Data / A.A. Rogotnev; A.S. Nikitiuk; O.B. Naimark; V.O. Nebogatikov; V.V. Grishko // AIP Conference Proceedings «International Conference on Physics of Cancer: Interdisciplinary Problems and Clinical Applications (PC IPCA’17)». – 2017. – Vol. 1882, No. 1. – P. 020060. http://dx.doi.org/10.1063/1.5001639DOI: 10.1063/1.5001639

6. Nikitiuk, A.S. Nonlinear dynamics of DNA with topological constraints / Nikitiuk A.S., Korznikova E.A., Dmitriev S.V., Naimark O.B. // Letters on Materials. – 2018. – V. 8. – No. 4. – P. 489-493. http://dx.doi.org/10.22226/2410-3535-2018-4-489-493 DOI: 10.22226/2410-3535-2018-4-489-493

7. (In Russian) Naimark, O.B. Assessment of nonlinear dynamics of cellular structure damage as a promising method of personalized cancer diagnostics / O.B. Naimark, A.S. Nikitiuk, V.O. Nebogatikov, V.V. Grishko // Almanac of Clinical Medicine. – 2018. – Vol. 46. – No. 8. – P. 592-597. https://doi.org/10.18786/2072-0505-201846-8-742-747DOI: 10.18786/2072-0505-201846-8-742-747

8. Rogotnev, A. Infrared Thermography Study of Breast Tissue Cancer Based on Phase Diagrams Analysis / A. Rogotnev; A. Nikitiuk; O. Naimark // // AIP Conference Proceedings «Proceedings of the advanced materials with hierarchical structure for new technologies and reliable structures». – 2018. – Vol. 2051, No. 1. – P. 020254. http://dx.doi.org/10.1063/1.5083497DOI: 10.1063/1.5083497

9. Nikitiuk, A.S. DNA breathers and cell dynamics / Nikitiuk A.S., Korznikova E.A., Dmitriev S.V., Naimark O.B. // Mathematical Biology and Bioinformatics. – V. 14. – No. 1. – 2019. – P. 137–149. https://www.matbio.org/2019/Nikitiuk_14_137.pdf DOI: 10.17537/2019.14.137

10. Rogotnev, A. Modeling of Heat Transfer in Breast by Modified Pennes Equation / A. Rogotnev; A. Nikitiuk; O. Naimark, V. Grishko // // AIP Conference Proceedings « Proceedings of the international conference on advanced materials with hierarchical structure for new technologies and reliable structures 2019». – 2019. – Vol. 2167, No. 1. – P. 020294. http://dx.doi.org/10.1063/1.5132161DOI: 10.1063/1.5132161

11. Nikitiuk A.S., Voronina A.O., Beloglazova Yu.A., Ozernykh O.S., Grishko V.V. and Naimark O.B. Study of Cancer and Normal Cells Dynamics Based on Laser Interference Microscopy // AIP Conference Proceedings « 28th Russian conference on mathematical modelling in natural sciences». – 2020. – V.2216. – P.060005 https://doi.org/10.1063/5.0003695DOI: 10.1063/5.0003695

12. Naimark O.B., Bayandin Y.V., Grishko V.V., Nikitiuk A.S. Mesoscopic Cell Mechanobiology and the Problem of Cancer // Organisms: Journal of Biological Sciences. - 2020. - V. 4, Is.1. - P. 42-56. https://doi.org/10.13133/2532-5876/16962DOI: 10.13133/2532-5876/16962

13. (In Russian) Bayandin Y.V., Nikitiuk A.S., Voronina A.O., Beloglazova Yu.A., Gagarskih O.N., Grishko V.V. and Naimark O.B. Analysis of morphometric and fractal properties of phase-contrast images of native and apoptotically altered mcf-7 cells // Russian Journal of Biomechanics. - 2020. - Vol. 24, No. 3. - P.312-322. https://vestnik.pstu.ru/biomech/archives/?id=&folder_id=9666DOI: 10.15593/RZhBiomeh/2020.3.04

14. (In Russian) Naimark, O.B. Mechanobiological study of the dynamics and morphology of cell structures by laser microscopy and applications in oncology / O.B. Naimark, V.V. Grishko, Y.V. Bayandin, A.S. Nikitiuk // Bulletin of the Perm Federal Research Center. – 2020. – No. 1. – P. 61-78. http://journal.permsc.ru/index.php/pscj/article/view/PSCJ2020n1p7DOI: 10.7242/2658-705X/2020.1.7

15. Beloglazova, Yu. Label-Free Single Cell Viability Assay Using Laser Interference Microscopy / Yu. Beloglazova, A. Nikitiuk, A. Voronina, O. Gagarskikh, Yu. Bayandin, O. Naimark, V. Grishko // Biology. – 2021. – Vol. 10. – No. 7. – P. 590. https://www.mdpi.com/2079-7737/10/7/590?utm_campaign=releaseissue_biologyutm_medium=emailutm_source=releaseissueutm_term=doilink40 DOI:10.3390/biology10070590

16. (In Russian) Ignatova, A.M. Analysis of the relief of MCF-7 tumor cells during apoptisis on the basis of phase-contrast images obtained by laser interference microscopy / A.M. Ignatova, A.S. Nikityuk, Yu.V. Bayandin, V.V. Grishko, O.B. Naimark // Computational Continuum Mechanics. – 2021. – V. 14, No. 2. – P. 171-176. http://journal.permsc.ru/index.php/ccm/article/view/CCMv14n2a14DOI: 10.7242/1999-6691/2021.14.2.14

17. Dmitriev, S. V. Scattering of small-amplitude phonons on discrete breathers in Fermi-Pasta-Ulam-Tsingou chain. / Dmitriev, S. V., Morkina, A. Y., Korznikova, E. A., Naimark, O. B., Nikitiuk, A. S., & Baggioli, M. // Computational Continuum Mechanics. – 2021. – V. 14, No. 4. – P. 444–453. http://journal.permsc.ru/index.php/ccm/article/view/CCMv14n4a37DOI: 10.7242/1999-6691/2021.14.4.37

18. Nikitiuk, A.S. Statistical thermodynamics of DNA with open states / A.S. Nikitiuk, Yu.V. Bayandin, O.B. Naimark // Physica A: Statistical Mechanics and its Applications. – 2022. – vol.  607. – P. 128-156. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378437122007142DOI: 10.1016/j.physa.2022.128156

19. Nikitiuk A. S., Burmistrova O.S., Naimark O.B. Study of the DNA denaturation based on the Peyrard-Bishop-Dauxois model and recurrence quantification analysis //Russian Journal of Biomechanics. – 2022. – Vol. 26. – no. 4. – P. 34-44. https://ered.pstu.ru/index.php/rjb/article/view/3596 DOI: 10.15593/RZhBiomeh/2022.4.03

20. Nikitiuk, A.S. On thermodynamics and relaxation properties of eukaryotic cells / A.S. Nikitiuk, A.A. Koshkina, Yu.V. Bayandin, O.B. Naimark // International Journal of Non–Linear Mechanics. – 2023. – vol. 157. – P. 104532. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0020746223001841?dgcid=authorDOI: 10.1016/j.ijnonlinmec.2023.104532

21. Nikitiuk, A.S. Parameter identification of viscoelastic cell models based on force curves and wavelet transform // Computer Research and Modeling. – vol. 15, no. 6. – P. 1653-1672. http://crm-en.ics.org.ru/journal/article/3417/DOI: 10.20537/2076-7633-2023-15-6-1653-1672

22. Nikitiuk A.S., Bayandin Yu.V., Naimark O.B. Study of nonlinear dynamic modes of native DNA via mathematical modeling methods // Russian Journal of Biomechanics. – 2023. – vol. 27, no. 4. – P. 59-69. https://vestnik.pstu.ru/get/_res/fs/file2.pdf/11779/Nikitiuk+A.S.%2C+Bayandin+Yu.V.%2C+Naimark+O.B.+%28Perm%2C+Russian+Federation%29.+Study+of+nonlinear+dynamic+modes+of+native+DNA+via+mathematical+modeling+methodsfile2.pdf DOI: 10.15593/RJBiomech/2023.4.05

23. Nikitiuk, A.S. Simulation of Constant Rate Loading of Eukaryotic Cells Using Statistical Thermodynamic Methods // Math. Biol. Bioinf. – 2024. – vol. 19, no. 2. – P. 304-321. https://www.matbio.org/article.php?lang=eng&id=576DOI: 10.17537/2024.19.304

24. Nikitiuk A. S., Bayandin Y. V., Naimark O. B. Orientation and shear mechanisms of finite deformation of the cell cytoskeleton //International Journal of Engineering Science. – 2025. – Vol. 214. – P. 104306. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002072252500093XDOI: 10.1016/j.ijengsci.2025.104306

25. Nikitiuk A. S., Bayandin Y. V., Naimark O. B. Finite deformation of the cell cytoskeleton: orientation and shear mechanisms // Continuum Mech. Thermodyn. – 2025. – Vol. 37 – P.65. https://link.springer.com/article/10.1007/s00161-025-01394-9 DOI: 10.1007/s00161-025-01394-9

26. Nikitiuk A. S., Bayandin Y. V., Naimark O. B. Cell Mechanobiology in Microgravity Conditions // Microgravity Science and Technology – 2025. – Vol. 37, no. 4. – P. 1-12. https://link.springer.com/article/10.1007/s12217-025-10186-4DOI: 10.1007/s12217-025-10186-4

27. Н.А. Князев, А.С. Никитюк, О.Б. Наймарк Щелевые импульсные состояния и дисперсионный анализ механического поведения вязкоупругих сред // Вестник Пермского национального исследовательского политехнического университета. Механика. – 2025. – № 2. – С. 57–69. DOI: 10.15593/perm.mech/2025.2.05

28. Nikitiuk A.S., Bayandin Y.V., Naimark O.B. Structural-Scaling Transitions and Criticality Cascade in DNA with Open States // International Journal of Molecular Sciences. – 2025. – Vol. 26, no. 17. – P. 8427. https://www.mdpi.com/1422-0067/26/17/8428DOI: 10.3390/ijms26178428

Являлся руководителем проектов:

- German-Russian Interdisciplinary Science Center, соглашение № B-2017b-7, «The study of the optical mechanical properties of cancer cells», 2017 гг, ссылка -https://www.g-risc.org/funded_projects/16th_Funding_Period/index.html.

- Фонда содействия инновациям конкурс УМНИК, соглашение № 12876ГУ/2018 гг, «Разработка метода диагностики и скрининга злокачественных опухолевых заболеваний на основе данных модуляционной интерференционной микроскопии», 2018 гг.

- гранта Президента Российской Федерации (Конкурс - МК-2022) № МК-44.2022.1.1, «Механобиологическое моделирование и лазерная микроскопия динамики субклеточных структур нормальных и опухолевых клеток», 2022-2023 гг.

Являлся исполнителем проектов:

- Правительства Пермского края, соглашение № C-26/614 от 19.12.2012 «Разработка многомасштабных подходов механобиологии при ранней диагностике в онкологии», 2012-2015 гг.

- Российского фонда фундаментальных исследований, № 13-01-96044 р_урал_а «Многомасштабное экспериментальное и теоретическое исследование механобиологии и гомеостаза опухолей», 2013-2015; №16-41-590235 р_а «Механобиологическое исследование фенотипов клеточных и тканевых структур в онкологии», 2016-2018 гг.

- Федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы» Минобрнауки России, № Соглашения 075-15-2019-061, название «Разработка программно-аппаратного комплекса для ранней диагностики злокачественных опухолей и анализа эффективности противоопухолевых препаратов методами интерференционной микроскопии и инфракрасной термографии», 2018-2020 гг.

На данный момент является руководителем проектов:

- Российского научного фонда № 24-24-00165 «Исследование механических свойств опухолевых клеток молочной железы человека методами статистической термодинамики, количественной фазовой микроскопии и с применением алгоритмов глубокого машинного обучения», 2024-2025 гг.

На данный момент является исполнителем проектов:

- по Государственному контракту № 124020200116-1 «Закономерности критичности в конденсированных средах и биологических мезо(нано)системах с дефектами, широкодиапазонное моделирование и экспериментальное исследование механизмов деформирования и стадийности поврежденности; перспективные приложения», 2024-2028 гг.